Όσον αφορά την κατηγοριοποίηση της ΠΩΑ, η πρωτοπαθής ωοθηκική ανεπάρκεια οφείλεται σε δυσλειτουργία των ωοθηκών, ενώ η δευτεροπαθής σχετίζεται με αδυναμία του υποθαλάμου και της υπόφυσης να παράγουν κανονικά επίπεδα γοναδοτροπινών, κάτι που με τη σειρά του επηρεάζει τη λειτουργία των ωοθηκών. Αιτίες που προκαλούν την ΠΩΑ είναι η εξάντληση των ωοθυλακίων που μπορεί να οφείλεται σε χρωμοσωμικές ανωμαλίες ή θεραπείες που επηρεάζουν τις ωοθήκες και η δυσλειτουργία των ωοθηκών που προκαλείται από αυτοάνοσα νοσήματα, γενετικές ανωμαλίες , έλλειψη ορισμένων ενζύμων και φλεγμονές.

Στην περίπτωση της πρωτοπαθούς ανεπάρκειας, η αποκατάσταση του εμμηνορυσιακού κύκλου είναι πιθανό να επιτευχθεί μέσω της χορήγησης οιστρογόνων και προγεστερόνης.

Εφόσον η ανεπάρκεια δεν είναι αναστρέψιμη και η πάσχουσα επιθυμεί να τεκνοποιήσει, συνήθης λύση είναι η δωρεά ωαρίων και η εξωσωματική γονιμοποίηση. Είναι σημαντικό να τονιστεί ότι εφόσον η ΠΩΑ διαγνωστεί εγκαίρως, η πρόγνωσή της είναι καλύτερη και οι πιθανότητες διατήρησης ή αποκατάστασης της γονιμότητας μεγαλύτερες.