Οι κύστεις στις ωοθήκες είναι ένα πολύ συχνό γυναικολογικό πρόβλημα, που παρουσιάζεται κυρίως κατά την αναπαραγωγική ηλικία. Παρ’ όλα αυτά, ορισμένες φορές οι κύστεις μπορεί να σχηματιστούν και πιο νωρίς, στη διάρκεια της παιδικής ηλικίας, ή αργότερα, μετά την εμμηνόπαυση. Πρόκειται για θυλάκους που παρουσιάζονται πάνω στην ωοθήκη ή μέσα σε αυτήν, περιέχουν υγρό και ποικίλλουν σε μέγεθος, από λίγα χιλιοστά έως και αρκετά εκατοστά. Στη συντριπτική τους πλειοψηφία, είναι καλοήθεις και εξαφανίζονται από μόνες τους σε διάστημα λίγων εβδομάδων, χωρίς να απαιτείται ιατρική παρέμβαση.
Στις περισσότερες περιπτώσεις, οι κύστεις δεν προκαλούν συμπτώματα ή παρουσιάζουν ήπια συμπτωματολογία και μπορεί να ανιχνευτούν τυχαία σε μια ιατρική εξέταση ρουτίνας. Ορισμένες κύστεις μπορεί να προκαλέσουν ενόχληση στην κοιλιακή χώρα και πόνο κατά τη διάρκεια κάποιων δραστηριοτήτων όπως το σεξ, η ούρηση ή η κινητικότητα του εντέρου. Οι μεγάλες σε μέγεθος κύστεις είναι δυνατόν να επιφέρουν συστροφή της ωοθήκης, με πόνο που μπορεί να αρχίσει ξαφνικά, να υποχωρεί και να επανέρχεται. Σε σπανιότερες περιπτώσεις μπορεί να αιμορραγήσουν ή να σπάσουν, προκαλώντας έντονο ξαφνικό πόνο.